Ang Parkinson ay nakakaapekto sa mga nerbiyos na lihim sa dopamine. Sinisira nito ang nerbiyos na inilipat mula sa nakulong na sangkap sa gitnang utak patungo sa basal ganglia. Sa post-mortem anatomy, ang nakulong na materyal ay apektado ng pagkawala ng melanin sa loob nito
Sa ilalim ng mikroskopyo, may pagkawala ng maraming nerbiyos sa lugar ng sangkap, at kapag ang pagsusuri ng mikroskopiko ng natitirang nerbiyos, may mga natatanging bagay sa loob ng mga neuron na tinatawag na mga katawan ng Lewy. Ang mga sintomas ng sakit na Parkinson ay karaniwang nagaganap pagkatapos ng 60-80% Kapag nawala ang dopamine, ang iba pang mga neurotransmitters ay nadaragdagan lalo na ang carinergic carrier, dahil ang kakulangan ng dopamine at pagtaas ng transportasyon ng cholinergic ay humantong sa sakit na Parkinson.